Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud4B2RRE7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms