Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf3B2RQG2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms