Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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AU022751B1B0V2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU022751B1B0V2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AU022751B1B0V2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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