Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CK137956B1AYM9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms