Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssxb8B1AY40 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssxb8B1AY40 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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