Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms