Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm436B1AVU6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm436B1AVU6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm436B1AVU6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm436B1AVU6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm436B1AVU6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm436B1AVU6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm436B1AVU6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm436B1AVU6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm436B1AVU6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm436B1AVU6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm436B1AVU6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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