Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ssxa1B1AUS7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ssxa1B1AUS7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxa1B1AUS7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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