Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn8B1ARD8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms