Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint8A7XV07 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint8A7XV07 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint8A7XV07 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint8A7XV07 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint8A7XV07 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint8A7XV07 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint8A7XV07 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint8A7XV07 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint8A7XV07 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint8A7XV07 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint8A7XV07 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms