Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms