Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtf1A2AQ19 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms