Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1aA2APX8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms