Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syndig1A2ANU3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms