Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cnksr1A2A9K7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Cnksr1A2A9K7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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Cnksr1A2A9K7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Cnksr1A2A9K7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Cnksr1A2A9K7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Cnksr1A2A9K7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Cnksr1A2A9K7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Cnksr1A2A9K7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Cnksr1A2A9K7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Cnksr1A2A9K7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Cnksr1A2A9K7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnksr1A2A9K7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms