Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap29-1A2A5X4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms