Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms