Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nlrp1bA1Z198 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms