Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trav12-2A0N8N6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trav12-2A0N8N6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trav12-2A0N8N6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trav12-2A0N8N6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trav12-2A0N8N6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trav12-2A0N8N6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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