Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms