Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms