Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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