Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trbv21A0A0A6YX06 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trbv21A0A0A6YX06 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trbv21A0A0A6YX06 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trbv21A0A0A6YX06 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trbv21A0A0A6YX06 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trbv21A0A0A6YX06 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trbv21A0A0A6YX06 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trbv21A0A0A6YX06 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trbv21A0A0A6YX06 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trbv21A0A0A6YX06 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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