Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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