Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms