Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRFP10586 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRFP10586 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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