Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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