Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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