Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTPRMP28827 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTPRMP28827 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTPRMP28827 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTPRMP28827 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTPRMP28827 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTPRMP28827 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTPRMP28827 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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PTPRMP28827 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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PTPRMP28827 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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