Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms