Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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SEMA3BQ13214 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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