Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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USP35Q9P2H5 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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USP35Q9P2H5 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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USP35Q9P2H5 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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USP35Q9P2H5 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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USP35Q9P2H5 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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USP35Q9P2H5 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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USP35Q9P2H5 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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USP35Q9P2H5 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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USP35Q9P2H5 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP35Q9P2H5 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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