Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm3550W4VSN7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm3550W4VSN7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms