Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms