Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms