Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd1Q9Z2E2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms