Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cldn6Q9Z262 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn6Q9Z262 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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