Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccl27Q9Z1X0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccl27Q9Z1X0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccl27Q9Z1X0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccl27Q9Z1X0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl27Q9Z1X0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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