Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nfs1Q9Z1J3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms