Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms