Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp2Q9Z0Z3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms