Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb6Q9Z0T9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms