Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms