Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme4Q9WV84 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme4Q9WV84 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms