Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms