Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms