Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trpv2Q9WTR1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms