Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spo11Q9WTK8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms