Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms