Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TapbpQ9R233 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms